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jueves, 14 de agosto de 2014

Gestor de referencias bibligráficas (Revisión bibliográfica I)

Durante la etapa de revisión bibliográfica encontramos muchos papers que podrían ser útiles para nuestra investigación por lo que necesitamos bajarlos, archivarlos ordenadamente para luego leerlos y seleccionar los papers que mejor nos ayuden a conocer nuestro tema o sustentar nuestras hipótesis de investigación. 

La opción tradicional de ordernar los papers en carpetas tiene las desventajas que no permite tener una descripción del archivo además que no hay manera de vincular el archivo a un documento en Microsoft Word y usarlo como referencia en nuestro paper. Los gestores bibliógraficos como Endnote, paperpile, Zotero, Refworks y otros llenan este vacio permitiéndonos ordenar y vincular los papers a nuestro documento en creación pudiendo elegir de estilos de citación previamente creados o incluso crear uno.

Debido a que Endnote es uno de los software que se puede vincular con las búsquedas de Google Scholar en  este post mostraré los pasos para poder configurar este vinculo, pero antes muestro una captura de pantalla de como luce Google Scholar antes de configurar el vinculo con Endnote:

1.- Primer paso: Con la cuenta de google abierta ir a Google Scholar y dar click en settings.

2.- Segundo paso: Ir hacia abajo a la sección Bibliography Manager y dar click en la opción "Show links to import citations into" y seleccionar de entre las opciones Endnote, luego dar click para volver a la pantalla original de Google Scholar.

Ahora en las búsquedas aparecerá  la opción "Import into Endnote":

Le damos click en Import to Endnote y un archivo en formato Endnote conteniendo la información de referencia del paper seleccionado se descargará.

jueves, 7 de agosto de 2014

Revisión bibliográfica (Revisión bibliógrafica II)

En las etapas iniciales de la investigación, cuando nos estamos familiarizando con nuestro tópico de interés la revisión bibliógrafica es de gran ayuda. No es nada nuevo que con la facilidad de difusión de conocimientos que brinda el internet la revisión es casi totalmente realizada online y es aqui donde surge el tema de este breve post: ¿Qué leer? 

Para responder esta pregunta debemos preguntarnos primero ¿cuál es nuestra variable dependiente y cuál nuestra variable independiente? Para ilustrar mi punto voy  a retomar el ejemplo clásico de fumado (variable independiente) y cáncer de pulmón (variable dependiente).

Supongamos alguien quien está en la primera etapa de su investigación y aun no delimita su tema está interesado en fumado y cáncer de pulmón y quiere encontrar qué información se ha publicado al respecto? Utilizando como fuente de información Google Scholar (o Google Académico en español da resultados de búsqueda más orientados a lo académico/científico que Google) voy a mostrar los primeros resultados cuando sólo se utiliza la variable independiente como criterio de búsqueda:

Y ahora la pregunta qué tan útiles son estos resultados para alguien que quiere estudiar Fumado y Cáncer de pulmón? El primer resultado es acerca de fumado (la variable independiente) e individualización del tratamiento (esta no es nuestra variable dependiente); el segundo resultado es acerca de las Consecuencias de salud (variable dependiente) del fumado (nuestra variable independiente). El tercer resultado es acerca del Abordaje de Etapas de Cambio (esta es la variable independiente de este paper, pero no es nuestra variable independiente) para ayudar a pacientes a Cambio de comportamiento (variable dependiente, pero no es nuestra variable dependiente). El último resultado de este ejemplo es acerca de la mortalidad atribuida al fumado (nuestra variable independiente) y los Años de Vida Potencialmente Perdidos (variable dependiente número 1, no es nuestra variable dependiente) y su Costo Económico (variable dependiente número dos, tampoco es nuestra variable dependiente).  En cada paper que leamos debemos indentificar la variable dependiente y la independiente. ¿Qué se puede leer de esta primera búsqueda (tomando en cuenta que estamos interesados en fumado y cáncer de pulmón)? Realmente ninguno de estos papers ayudarían a darnos un mejor conocimiento sobre nuestro tema de interés.

Ahora voy a realizar una búsqueda usando la variable independiente y dependiente del ejemplo y mostraré dos resultados:

En este caso obtengo este paper (solo muestro este ejemplo para ilustrar) que es acerca de Las esposas de los fumadores asiduos (variable independiente) tienen alto riesgo de Cáncer de Pulmón (nuestra variable dependiente) en Japón. Este paper podría ser una buena opción de lectura, aunque si encontraramos uno de un contexto más cercano al de latinoamerica sería mejor. La revisión bibliográfica nos ayuda a delimitar nuestro tema, estamos interesados en Fumado y Cáncer de Pulmón, pero en qué población? en mujeres adultas? en mujeres solteras? en hombres adultos? en adolescentes?. Este paper estudia la relación de Fumado y Cáncer de Pulmón pero en esposas no fumadoras de fumadores asiduos, un subgrupo poblacional bien específico.

El otro resultado que muestro es este:

Este paper es acerca de Cáncer de pulmón (variable dependiente) y fumado pasivo (variable independiente). Este paper también sería una buena opción de lectura. Algunas claves para delimitar el tema surgen de este resultado por ejemplo en qué tipo de fumado estamos interesados? fumado activo? fumado pasivo?

Ahora voy a resumir en tres puntos la respuesta a la pregunta: Qué leer?

1. Leer papers relacionados a nuestra variable dependiente (también llamada variable resultado o Y) y nuestra variable independiente (también llamada variable explicativa, predictiva o X).
2. Empezar con los papers que tengan más citaciones, en la figura de abajo he dibujado un circulo para mostrar el lugar de las citaciones:

Las citaciones son un indicador del aporte cientifíco del paper al tema de estudio y en general mientras más citaciones tenga un paper indica que su difusión y aporte ha sido grande. Sin embargo, no siempre es asi y para ilustrar esto voy a poner el ejemplo de MacMahon, 1981

Si nos dejamos guiar solamente por el número de citaciones este paper que trata de la asociación entre Café y Cáncer de Páncreas sería una excelente opción para leer debido a que tiene 477 citaciones, sin embargo este paper ha sido citado como un ejemplo de sesgo de selección, no por haber contribuido con conocimiento verdadero al mundo científico.  El número de citaciones es sólo uno entre otros criterios para seleccionar qué leer. Nuestro conocimiento de Epidemiología y Metodología de Investigación nos ayuda a identificar si un paper ha sido citado por sus aportes al conocimiento científico o como un ejemplo de un estudio con una conducción y/o análisis defectuoso.

3. De preferencia leer estudios longitudinales en lugar de estudios de corte transversal. Los estudios longitudinales (cohorte) son menos susceptibles al sesgo de selección o información que los de corte transversal, además permiten establer temporalidad entre la variable independiente y la variable dependiente.